寺院由于建设了往生堂，堂内存放着亡人的骨灰，以求佛菩萨的加持，得以超度，依佛教来讲，完全可以。寺庙存放骨灰收费是否合法

　　依据国务院的《殡葬管理条例》第五条规定，在实行火葬的地区，国家提倡以骨灰寄存的方式以及其他不占或者少占土地的方式处理骨灰。从事殡葬业务必须由政府民政部门批准。第十八条规定，未经批准，擅自兴建殡葬设施的，由民政部门会同建设、土地行政管理部门予以取缔，责令恢复原状，没收违法所得，可以并处违法所得1倍以上3倍以下的罚款。

　　根据佛教传统，寺庙可修建接引殿存放佛教四众弟子的灵骨。另外由政府决定的新建、重建寺庙，为解决寺庙迁建带来的巨额费用，经民宗局同意，寺庙修建殿堂为佛教徒提供存放灵骨的服务，不对外经营。凡为寺庙建设提供相应捐助的佛教徒，在其亡故后，寺庙会为其提供一个存放骨灰的位置，以感念其功德。由于不对外经营，只对捐助者提供捐助凭证，所以也不会存在违法问题。

　　综上所述需要看您存放寄存骨灰寺院的具体情况确定收费是否合法。